Şener Eruygur 17 Haziran 1941’de Erzurum’da doğdu.
1958’de Kuleli Askerî Lisesini bitiren Eruygur, 1960 yılında Kara Harp Okulundan topçu subayı olarak mezun oldu.
Eruygur 1961 yılında Topçu Okulunu bitirdikten sonra 1971 yılına kadar çeşitli topçu birliklerinde Takım ve Batarya Komutanlığı ve Karargâh Subaylığı yaptı.
1971 yılında girdiği Kara Harp Akademisinden 1973’te mezun oldu.
1974 yılında Erzurum Atatürk Üniversitesi İşletme Fakültesini bitirdi; 1975 yılında NATO Savunma Kolejinden mezun oldu.
1976 yılına kadar çeşitli kıta ve karargâhlarda görev alan Eruygur, 1976-1978 yılları arasında Bükreş Kara Ataşeliği görevini yürüttü.
Eruygur sırasıyla; 5’inci Kolordu Topçu Grup Komutanlığı ve 105’inci Topçu Alay Komutanlığı, Kara Harp Akademisi Öğretim Üyeliği ve 1’inci Ordu Harekât Başkanlığı görevlerinde bulundu.
1987 yılında Tuğgeneral rütbesine terfi eden Şener Eruygur, bu rütbede Millî Savunma Bakanlığı Asker Alma Daire Başkanlığı ve 49’uncu Piyade Tugay Komutanlığı görevlerini yürüttü.
1991 yılında Tuğgeneralliğe yükselen Eruygur, 1993 yılına kadar sürdürdüğü Millî Savunma Bakanlığı Asker Alma Daire Başkanlığı görevinin ardından, 1993-1996 yıllarında Topçu Füze Okulu ve Eğitim Merkez Komutanlığı yaptı.
Şener Eruygur 1996 yılında Korgeneralliğe terfi etti ve bu rütbeyle sırasıyla 5’inci Kolordu Komutanlığı ve Millî Savunma Bakanlığı Müsteşarlığı görevlerini yürüttü.
2000 yılında orgeneral rütbesine terfi eden Eruygur, Kara Kuvvetleri Kurmay Başkanlığı görevinin ardından 2002 yılında Jandarma Genel Komutanı olarak atandı.
Türkiye Cumhuriyeti’nin 38’inci Jandarma Genel Komutanı Orgeneral Şener Eruygur, 30 Ağustos 2004 itibarıyla emekliye ayrıldı.
İstanbul’da hayatını kaybeden Emekli Orgeneral Şener Eruygur, Fransızca ve İngilizce biliyordu.
Eruygur, Mukaddes Eruygur ile evliydi ve iki çocuk babasıydı.
Emekli Orgeneral Şener Eruygur’un cenazesi yarın (21 Şubat 2023) İstanbul Selimiye Camisi’nde öğle vakti kılınacak namazın ardından Karacaahmet Mezarlığı’nda toprağa verilecek.